清朝年间，蛇肯点素村人烟甚少，且长有大片枳芨草，环境幽静，充满西部边塞风情。同时，当时的蒙古族人民以游牧生活为主，少数蒙古族人在经过此地时见长有枳芨草，且毗邻黄河，便在此开始游牧生活，且称此地为“希更德日斯”，即有枳芨粪土的地方，后音变为“蛇肯点素”，故名蛇肯点素。
随着人口不断的迁移，该地人口逐渐增多，直到1958年，组了建蛇肯点素大队，由十二顷地、召圪梁、赵四窑子、蛇肯点素4个小队组成。1977年，划出十二顷地、召圪梁，由赵四窑子、蛇肯点素2个小队组成。1978年，赵四窑子、蛇肯点素又与召圪梁合并；80年代又将召圪梁划出；90年代初，将蛇肯点素与赵四窑子也划分开，蛇肯点素单独成为一个大队。直到2006年，才将蛇肯点素、赵四窑子、召圪梁3个队合并为如今的蛇肯点素村。